1.安装lammps前需要安装fftw和mpich吗
必须的,记住安装路径,编译lammps时要修改makefile.g++文件,需要用到fftw和mpich的路径。
另外系统还要安装g++,或者,直接安装build-essential也行。fftw最好用2-1.5版本的,mpich也用2-1.5版本的。
建议不要用笔记本电脑运行lammps,对本本伤害很大,用笔记本来测试还是可行的。一般lammps的计算量非常大,动则上百万千万步,用一个CPU算太慢,所以lammps通常都是并行版,并行版的意思就是你可以同时利用多个CPU进行同一个计算。
有计算任务的时候先用本本测试脚本是否可以运行,用vmd查看建立的模型是不是自己想要的,如果没问题再拿到台式机上运行。fftw的安装路径可以自己选择,但如果不是在主文件夹下的话,需要用root身份安装。
安装时没有出现错误之类的提示,那么就是安装成功了。
2.lammps该怎么入门
1、如果对lammps是否可以做东西感到不确定,可以给作者写信问一下。作者是个好人,一般都会回复。
2、lammps对linux系统没有特别的要求,只有有g++都行。redhat,suse,ubuntu等,这些系统都能满足需要。可能就是一些linux系统对新硬件支持不够。ubuntu它对新硬件支持不错。
3、确定使用lammps后,就要对他毫不怀疑,不能自己动摇。因为在学习lammps的过程中你会遇到很多很多困难,但是坚持就是胜利!
4、开始自己做东西之前必须得啃掉手册。可以先通读一遍,然后就自己感兴趣的内容细细琢磨一遍。接着就是学习命令了,特别是对那些重点的命令,就得一个一个字地看,弄清楚这个命令中每个符号的含义。否则你自己编写in文件的时候还得花费时间回头看这些命令的用法。建议先把例子看懂,结合例子来学习手册和命令。
5、多和别人讨论,也许别人一句话就能让你产生灵感。
3.lammps该怎么入门
1、如果对lammps是否可以做东西感到不确定,可以给作者写信问一下。
作者是个好人,一般都会回复。2、lammps对linux系统没有特别的要求,只有有g++都行。
redhat,suse,ubuntu等,这些系统都能满足需要。可能就是一些linux系统对新硬件支持不够。
ubuntu它对新硬件支持不错。3、确定使用lammps后,就要对他毫不怀疑,不能自己动摇。
因为在学习lammps的过程中你会遇到很多很多困难,但是坚持就是胜利!4、开始自己做东西之前必须得啃掉手册。可以先通读一遍,然后就自己感兴趣的内容细细琢磨一遍。
接着就是学习命令了,特别是对那些重点的命令,就得一个一个字地看,弄清楚这个命令中每个符号的含义。否则你自己编写in文件的时候还得花费时间回头看这些命令的用法。
建议先把例子看懂,结合例子来学习手册和命令。5、多和别人讨论,也许别人一句话就能让你产生灵感。
4.安装lammps前需要安装fftw和mpich吗
必须的,记住安装路径,编译lammps时要修改makefile.g++文件,需要用到fftw和mpich的路径。
另外系统还要安装g++,或者,直接安装build-essential也行。fftw最好用2-1.5版本的,mpich也用2-1.5版本的。
建议不要用笔记本电脑运行lammps,对本本伤害很大,用笔记本来测试还是可行的。一般lammps的计算量非常大,动则上百万千万步,用一个CPU算太慢,所以lammps通常都是并行版,并行版的意思就是你可以同时利用多个CPU进行同一个计算。
有计算任务的时候先用本本测试脚本是否可以运行,用vmd查看建立的模型是不是自己想要的,如果没问题再拿到台式机上运行。 fftw的安装路径可以自己选择,但如果不是在主文件夹下的话,需要用root身份安装。
安装时没有出现错误之类的提示,那么就是安装成功了。
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